小编2020年写过多篇与新冠病毒的文章,比如:
【情报实战】美国公司吉利德为什么会有新型冠状病毒肺炎的特效药瑞德西韦
【情报实战】发论文说新型冠状病毒并非来自实验室的教授和美国马里兰州的生物研究基地有什么关系?
美国马里兰州德特里克堡生物研究基地与美军泰国医学研究中心(USAMC-AFRIMS)是什么关系?
虽然一系列的文章都用事实说明美国一直研究基因编辑技术,有编辑和制造包括新型冠状病毒在内的各种新的非天然病毒的能力。新冠疫情在全球肆虐,并造成美国六十余万民众死亡,但美国不依靠其强大的生物科研能力开展新冠病毒溯源,也不允许世界卫生组织等国际组织到美国开展病毒溯源。其总统反而要求情报部门要在90天内给出一个病毒溯源报告。
其实美国情报部门人员、经费和技术都是全球最牛的,相信他们稍微用点开源情报的分析能力就能从美国政府自己官方网站的数据信息来找到很多证据,比如:早在新型冠状病毒出现之前,美国政府就一直在资助利用基因技术对各种病毒进行人工修饰和改造,创造非天然的病毒。
一、在美国专利网站搜索编辑合成基因的专利
通过美国专利搜索网站:https://patft.uspto.gov/
限定在专利标题中搜索“assembly”和 “genomes”(组装基因),可搜索到两条专利:
专利号:6593111,专利名称:大病毒基因组和染色体的定向组装,最早关联申请2000 年 5 月 21 日
专利号:6521427,专利名称:基因和基因组的完整化学合成和组装方法,最早关联申请1997 年 9 月 16 日
6521427号专利“基因和基因组的完整化学合成和组装方法”的部分内容:
本申请要求 1997 年 9 月 16 日提交的第 60/059,017 号的权益。
发明人:Glen A. Evans (San Marcos, CA)
受让人:Egea Biosciences, Inc. (San Diego, CA)
本发明总体上涉及寡核苷酸合成领域。更具体地说,它涉及完全合成的人工生物的基因和基因组的组装。
发明背景
目前分子生物学的研究和商业应用基于 1970 年代开发的重组DNA。重组DNA的一个关键方面是质粒中的分子克隆,Cohen和Boyer的开创性专利(美国专利第 4740470 号“生物学功能分子嵌合体”)涵盖了这一点。该专利传授了一种基于限制性核酸内切酶“切割和剪接”DNA分子的方法,将这些“重组”分子引入宿主细胞,以及它们在细菌宿主中的复制。该技术是过去 20 年来用于研究和商业目的的所有分子克隆的基础,也是分子生物学和遗传学领域的基础。
重组 DNA 技术是一项强大的技术,但在现有 DNA 序列的修饰方面的效用有限,这些序列通过 1) 限制性酶切位点,2) 用于扩增的 PAC 引物,3) 位点特异性诱变和其他技术进行修饰。创建一个全新的分子,或对现有分子进行实质性修改,非常耗时、昂贵,需要复杂的多个步骤,在某些情况下是不可能的。重组DNA技术不允许创建完全人工的分子、基因、基因组或生物体,而只能对天然存在的生物体进行修饰。
当前用于工业生产、药物设计和开发、疫苗开发和基因治疗的潜在应用以及重组 DNA的农业和环境应用的生物技术依赖于天然存在的生物体和DNA 分子。为了创造或设计新的或新颖的功能,或修改生物体以供专门用途(例如产生人类激素),需要对天然存在的 DNA分子进行极其复杂、耗时且困难的操作。在某些情况下,自然发生的DNA的变化非常复杂,以至于在实践中是不可能的。因此,需要允许在单个步骤中创建新的DNA分子而不需要使用任何现有的重组或天然存在的DNA 的技术。
发明内容: 因此,在第一个实施方案中,提供了一种构建双链 DNA 区段的方法,包括以下步骤 (i) 提供两组单链寡核苷酸,其中 (a) 第一组包含完整的正链所述DNA片段的一部分,(b)第二组包含所述DNA片段的整个负链,以及(c)所述第一组寡核苷酸中的每一个与所述第二组寡核苷酸的两个寡核苷酸互补,(ii)使所述第一组退火和所述第二组寡核苷酸,和(iii)用连接酶处理所述退火的寡核苷酸。可选步骤提供寡核苷酸组的合成和宿主细胞与所得DNA片段的转化。
本发明通过提供用于产生几乎任何核酸序列(包括完整基因、染色体片段、染色体和基因组)的快速、有效手段来解决现有重组核酸操作的局限性。由于该方法基于完全合成的方法,因此没有限制,例如现有核酸的可用性,以阻碍甚至非常大的核酸片段的构建。
6593111号专利“大病毒基因组和染色体的定向组装”的部分内容:
本发明是在美国国立卫生研究院的授权号 AI23946-08 下在政府支持下完成的。美国政府对本发明拥有一定的权利。
本申请要求于 2000 年 5 月 21 日提交的美国临时申请第 60/206,537 号和2001 年 4 月 20 日提交的美国临时申请第 60/285,320 号的权益,两者整体均通过引用并入本文。
发明人:Ralph S. Baric(Haw River, NC), Boyd Yount (Hillsborough, NC)
受让人:University of North Carolina at Chapel Hill (Chapel Hill, NC)
发明背景 目前已知的遗传操纵许多病毒、植物、动物和细菌基因组的方法通常使用重组或转导方法来引入外源序列或改变生物体基因组中的基因。根据引入的有效载荷序列和生物体的生物学,这些方法可能存在问题。此外,可能需要多个基因操作/重组事件来构建适当的基因型。 由于全长 cDNA 克隆的可用性,RNA 病毒基因组的结构和功能的分子遗传分析得到了极大的推进,全长 cDNA 克隆是感染性 RNA 转录物的来源,当被引入到允许细胞系中时,可以有效
发明涉及大基因组的定向组装,更具体地,涉及大病毒基因组的定向组装。
病毒、细菌、植物和其他生物(包括人类)的基因组正在被系统地克隆和测序。需要方法将较小的 DNA 亚克隆定向组装成这些生物的全长、功能完整的基因组或染色体。这种方法可以对整个植物和动物的个体染色体进行精确的遗传操作,并可以构建用于基因治疗的人工染色体。由于目标核酸的大尺寸以及无法系统地将单个 DNA 克隆组装成全长基因组,常规方法通常不成功。
传染性胃肠炎病毒 (TGE) 是 I 组冠状病毒,包含大约 28.5 Kb 的基因组 RNA,该 RNA 被包装成螺旋状核衣壳结构,并被包含三个病毒特异性糖蛋白刺突的包膜包围,包括 S 糖蛋白、膜糖蛋白 (M ) 和小包膜糖蛋白 (E)。传染性胃肠炎病毒 (TGE) 基因组是多顺反子,编码九个大的开放阅读框 (ORF),它们在感染期间从全长或亚基因组长度的 mRNA 表达。这些基因在两个大的 ORF 中编码,称为 1a 和 1b,后者通过核糖体移码表达。ORF1a 至少编码两种病毒蛋白酶和其他几种非结构蛋白,而 ORF1b 包含聚合酶、解旋酶和 RNA 聚合酶典型的金属结合基序。在 TGE 基因组的 3'-最 9 Kb(大约)中,每个下游 ORF 前面都有一个高度保守的基因间序列元件,它指导六个或七个亚基因组 RNA 中的每一个的合成。这些亚基因组 mRNA 从基因组 3' 端以嵌套结构排列,并包含源自基因组 5' 端的前导 RNA 序列。除了病毒 mRNA 之外,全长和亚基因组长度的负链 RNA 也参与 mRNA 合成。冠状病毒复制的另一个独特特征是与感染相关的高 RNA 重组频率。
冠状病毒基因组的大尺寸,加上无法在微生物载体中克隆聚合酶基因的一部分,阻碍了在冠状病毒科中进行精确操作和反向遗传学的能力。最近,在细菌人工染色体 (BAC) 载体中组装了 TGE 的全长 cDNA 克隆。冠状病毒独特的复制策略使其成为表达多种外源基因的有吸引力的候选载体。
发明内容 因此,本发明的第一个方面是通过获得一组病毒基因组的亚克隆来合成重组病毒基因组的方法,其中每个亚克隆的末端是一个限制性位点,然后连接亚克隆形成重组病毒基因组。基因组优选地是具有与天然基因组相同的活性(功能)的全长病毒基因组,并且更优选地是感染性病毒基因组(即,能够感染许可细胞)。在某些实施方案中,亚克隆包含突变(即,具有不同于野生型基因组的序列)。在其他实施方案中,组装的基因组还包含异源核酸。在一个优选的实施方案中,病毒基因组是冠状病毒基因组。本发明产生的重组病毒基因组是本发明的另一方面。用本发明的基因组感染细胞的方法是本发明的又一方面。在这些方法的优选实施方案中,基因组是在细胞中表达异源核酸的载体。
本发明涉及一种用于组装大RNA和DNA病毒的功能性全长基因组的简单、系统的方法。本发明以全长、功能性冠状病毒基因组的组装为例,但不限于此。本发明人已成功组装了传染性胃肠炎病毒(TGE)的全长感染性克隆。使用一种新方法,分离了跨越整个 TGE 基因组的六个相邻 cDNA 亚克隆。每个克隆都设计有独特的侧翼互连连接点,这些连接点要求仅与正确的相邻 cDNA 亚克隆进行精确、系统的组装,从而产生约 28.5 Kb 长度的完整 TGE cDNA 构建体。发现源自全长 TGE 构建体的转录本具有传染性,和后代病毒粒子在允许的宿主细胞中连续传代。病毒抗原和亚基因组 mRNA 合成在感染期间和整个传代过程中都很明显。发现源自感染性构建体的噬菌斑纯化病毒在允许的宿主细胞中有效复制。重组病毒通过独特的互连连接进行测序,最终证明了独特的标记突变和被设计到组分克隆中的限制性位点。除其他优点外,TGE 的全长传染性克隆允许对冠状病毒基因组进行精确的遗传修饰。发现源自感染性构建体的噬菌斑纯化病毒在允许的宿主细胞中有效复制。重组病毒通过独特的互连连接进行测序,最终证明了独特的标记突变和被设计到组分克隆中的限制性位点。除其他优点外,TGE 的全长传染性克隆允许对冠状病毒基因组进行精确的遗传修饰。发现源自感染性构建体的噬菌斑纯化病毒在允许的宿主细胞中有效复制。重组病毒通过独特的互连连接进行测序,最终证明了独特的标记突变和被设计到组分克隆中的限制性位点。除其他优点外,TGE 的全长传染性克隆允许对冠状病毒基因组进行精确的遗传修饰。
事实1:在美国国立卫生研究院的项目经费资助下,北卡罗来纳大学教堂山分校的拉尔夫·S·巴里克(Ralph S.Baric),博伊德·扬特(Boyd Young)在2000年就已经人工合成具有传染性的胃肠炎病毒。同时也在开展组装冠状病毒的研究。
二、利用专利网站检索美国国立卫生研究院的项目AI23946还支持了哪些专利
居然有个专利:重组冠状病毒的生产方法(Methods for producing recombinant coronavirus)专利号:7279327
发明人:克里斯托弗·M·柯蒂斯(Kristopher M. Curtis)(Chapel Hill, NC), 博伊德·扬特(Boyd Yount)(Hillsborough, NC), 拉尔夫·S·巴里克(Ralph S. Baric)(Haw River, NC)
受让人:北卡罗来纳大学教堂山分校(The University of North Carolina at Chapel Hill) (Chapel Hill, NC)
2002 年 4 月 19 日PCT 申请。
关键是联邦支持声明:
本发明是在美国国立卫生研究院的资助号AI23946和GM63228下,在政府支持下实现的。美国政府对本发明拥有一定的权利。
本发明涉及完全合成的人工生物的基因和基因组的组装。
部分发明内容:
本发明通过提供用于产生几乎任何核酸序列(包括完整基因、染色体片段、染色体和基因组)的快速、有效手段来解决现有重组核酸操作的局限性。由于该方法基于完全合成的方法,因此没有限制,例如现有核酸的可用性,以阻碍甚至非常大的核酸片段的构建。
在计算机的帮助下,发明人能够使用高通量寡核苷酸合成仪作为一组重叠组分寡核苷酸指导载体/基因组合的合成。使用机器人组合组装策略组装寡核苷酸,并使用 DNA 连接酶或拓扑异构酶连接组装,然后转化为合适的宿主菌株。在一个特定的实施方案中,本发明产生一组细菌菌株,其包含基因组确定区域中所有基因的可行表达载体。在其他实施方案中,还考虑酵母或杆状病毒表达载体系统以允许在真核宿主的染色体区域中表达每个基因。在具体实施方案中,本发明提供了一种合成有复制能力的双链多核苷酸的方法,其中该多核苷酸包含复制起点、第一编码区和指导第一编码区表达的第一调控元件。
此外,该方法还可包括扩增双链多核苷酸的步骤。在某些其他实施方案中,预期编码区编码参与细胞过程的酶,选自细胞分裂、分子伴侣、解毒、肽分泌、能量代谢、调节功能、DNA复制、转录、RNA加工和tRNA修饰. 在优选的实施方案中,能量代谢是氧化磷酸化。
预期双链多核苷酸是DNA或RNA。在优选的实施方案中,双链多核苷酸可以是染色体。双链多核苷酸可以是表达构建体。具体地,表达构建体可以是细菌表达构建体、哺乳动物表达构建体或病毒表达构建体。在特定实施方案中,双链多核苷酸包含细菌基因组、酵母基因组、病毒基因组、哺乳动物基因组、两栖动物基因组和鸟类基因组组成的组的基因组。
在基因组是病毒基因组的那些实施方案中,病毒基因组可选自逆转录病毒、腺病毒、痘苗病毒、疱疹病毒和腺相关病毒。
本发明进一步提供了一种生产病毒颗粒的方法。
另一个实施方案提供了产生人工基因组的方法,其中染色体包含在相应天然染色体中发现的所有编码区和调控元件。在具体实施方案中,相应的天然染色体是人线粒体基因组。
还提供了一种产生人工遗传系统的方法,其中该系统包括在相应的天然生化途径中发现的所有编码区和调控元件。这种生化途径可能拥有一组连续代谢化合物的酶。在特别优选的实施方案中,生化途径包括糖酵解所需的活性。在其他实施方案中,生化途径包括电子传递所需的酶。在更进一步的实施方案中,生化途径包括光合作用所需的酶活性。
事实2:在美国国立卫生研究院资助下,北卡罗来纳大学教堂山分校得到克里斯托弗·M·柯蒂斯(Kristopher M. Curtis), 博伊德·扬特(Boyd Yount), 拉尔夫·S·巴里克(Ralph S. Baric)在2002年4月以前就能完全靠人工合成的方法制造的染色体保护天然染色的的所有编码区和调控元件。构建体包括细菌基因组、酵母基因组、病毒基因组、哺乳动物基因组、两栖动物基因组和鸟类基因组。
事实3:2002年11月,中国广东出现第一例非典型肺炎(SARS)
三、利用专利网站检索上述三人还有申请了哪些专利,这些专利都有哪些政府项目支持
专利号 | 专利名称 |
7,618,802 | 具有抗重组基因组的冠状病毒的组成 |
8,207,316 | HCMV 相关核酸和 microRNA |
8,466,283 | 取代的 2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉衍生物可用于治疗过度增殖性疾病和与血管生成相关的疾病 |
8,748,146 | 工程核酸酶及其在核酸组装中的用途 |
8,859,572 | 砜取代的 2,3-二氢咪唑并 [1,2-C] 喹唑啉衍生物可用于治疗过度增殖性疾病和血管生成疾病 |
8,895,549 | 用于治疗过度增殖性疾病和与血管生成相关的疾病的氨基醇取代的 2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉衍生物 |
8,916,588 | 注意缺陷多动障碍的治疗方法 |
9,044,486 | 猫传染性腹膜炎的预防或治疗方法 |
9,675,616 | 芳氨基醇取代的2,3-二氢咪唑并[1,2-C]喹啉 |
9,730,943 | 烷氧基取代的 2,3-二氢咪唑并[1,2-C]喹唑啉 |
9,821,050 | 包含突变结构域 I 和结构域 II 铰链区的嵌合登革病毒 E 糖蛋白 |
9,884,895 | 嵌合冠状病毒刺突蛋白的方法和组合物 |
9,902,727 | 用于治疗过度增殖性疾病和与血管生成相关的疾病的氨基醇取代的 2,3-二氢咪唑并[1,2-C]喹唑啉衍生物 |
9,909,985 | 多重叠加界面图案多孔微结构多层生物传感方法 |
9,975,923 | 用于诺如病毒阻断表位的方法和组合物 |
9,999,623 | 取代的2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉用于治疗淋巴瘤的用途 |
10,053,493 | 登革病毒疫苗的方法和组合物 |
10,117,924 | 包含突变结构域 I 和结构域 II 铰链区的嵌合登革病毒 E 糖蛋白 |
10,202,385 | 取代的 2,3-二氢咪唑并[1,2-C]喹唑啉的用途 |
10,226,469 | 取代的2,3-二氢咪唑并[1,2-C]喹唑啉用于治疗淋巴瘤的用途 |
10,383,877 | 取代的2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉在治疗骨髓瘤中的用途 |
10,393,745 | 癌症的诊断和预后方法 |
10,398,768 | 用于疫苗和诊断开发的重组登革病毒的方法和组合物 |
10,844,066 | 2-氨基-N-[7-甲氧基-2, 3-二氢咪唑并-[1,2-c] quinazolin-5-yl] pyrimidine-5-carboxamides |
10,870,682 | 登革病毒疫苗的方法和组合物 |
11,028,314 | 包含胺化糊精化合物的组合物和使用其的地下处理方法 |
RE46,856 | 取代的 2,3-二氢咪唑并[1,2-c]喹唑啉衍生物可用于治疗过度增殖性疾病和与血管生成相关的疾病 |
该发明得到了国家健康、过敏和传染病研究所的政府资助,资助号为A123946 和 GM 63228。
该发明是在美国国立卫生研究院授予的资助号 U54AI057157 的政府支持下完成的。
3、用于诺如病毒阻断表位的方法和组合物
该发明是在美国国立卫生研究院授予的授权号 AI056351 下在政府支持下完成的。
4、嵌合冠状病毒刺突蛋白的方法和组合物
该发明是在美国国立卫生研究院授予的拨款号U54AI057157 的政府支持下完成的。
该发明是在美国国立卫生研究院授予的资助号 AI 057157、AI 097560、AI 107731 和 AI 109761 的政府支持下完成的。
该发明是在美国国立卫生研究院授予的资助号 U54AI057157 的政府支持下完成的。
四、再对上述专利中涉及的政府资助项目进行检索,重复上述过程可发现一大堆涉及病毒研究的专利、政府资助项目
该发明是在美国国立卫生研究院授予的资助号 A1103038、AI096833、AI057157、AI114816 和 HHSN272201400018C 以及国防部授予的资助号 W911NF-13-1-0417 的政府支持下完成的。
本发明是在政府支持下完成-AI057157 和R56-AI087673授予由美国国立卫生研究院。
本发明获得了美国国立卫生研究院资助 AI060989、AI077099、U54 AI057157和美国国立卫生研究院合同 HHSN272200900042C 的政府支持。
本发明是在政府支持下完成的,U54 AI057157 -06、AI073843、T32 HL069765 和 AI069233 均由美国国立卫生研究院授予。
本发明是在美国国家卫生研究院授予编号 AI56363 和AI057157 的美国政府支持下完成的。
本发明是在美国国立卫生研究院授予的资助号 U54 AI057157和 U19 AI057229 的政府支持下完成的 。
本发明是在 NIH/NIAID 资助AI048638、AI0564499、AI056947、AI057157、 AI05726601 和 NIH/NIDDK 资助 DK057665 的政府支持下完成的。
本发明是在美国国立卫生研究院授予的资助号 R01-AI33657、R01 HL-075363 和 P01 HL-51670 的政府支持下完成的。
本发明得到了美国国立卫生研究院合同HHSN272200900042C 的政府支持。
本发明得到了美国国立卫生研究院合同HHSN272200900042C 的政府支持。
事实4:美国政府在资助研究和制作各种新型的冠状病毒、结核病毒、流感病毒、登革热病毒、诺如病毒、基孔肯雅病毒等等各种病毒。
事实5:自从美国拥有制造病毒的能力后,全球就各种来源不明的突发疫情就接踵而至。
五、还可通过政府官网、受资助机构官网等网站查看相关资助项目的内容、金额、运用情况等等。
部分专利文档和机器翻译文档已上传小编知识星球
长按识别下面的二维码可加入星球下载
里面已有近千篇资料可供下载
越早加入越便宜哦